菜寮溪為臺南市南化區易淹水潛勢區，受今日(0625)短延時強降雨影響，南化區最大時雨量88毫米，3小時174毫米，造成菜寮溪水位高漲，上游支流因受溪水高漲頂托影響，排水困難，致台20線沿線部分橋樑預警性封閉，並致菜寮溪支流沿岸中坑里水淹逾1公尺深，共計2戶10位民眾受困，黃偉哲市長立即指示臺南市政府消防局及南化區公所盡速撤離受困民眾。

該菜寮溪支流淹水地點位屬國有林事業區交界，大部分為農業部林業及自然保育署管理之土地，且該段菜寮溪係屬經濟部水利署第六河川分署管轄，邱忠川局長指示，後續將邀集2單位研商淹水情形，以利推動辦理相關排水改善作業，以期全面提升區域排洪能力，確保市民生命財產安全。